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增值税普通发票与发票是企业在销售商品或提供服务时开具的两种不同类型的发票。它们之间的区别在于：

适用范围不同：普通发票适用于销售商品和提供一般纳税人服务的场合，而发票适用于销售货物和提供服务给其他企业的场合。

发票形式不同：普通发票可以是纸质发票或电子发票，而发票只能是纸质发票。

税率不同：普通发票适用的税率一般是13%或17%，而发票适用的税率可以是3%、4%、5%、6%、9%、10%、11%、16%、17%。

开票要求不同：发票需要事先向税务机关申请，并且开具的销售或服务合同，而普通发票则无此要求。

企业被税务机关稽查，是一件让企业非常忧虑的事情。为了应对这种情况，企业需要采取以下措施：

1.了解相关政策法规：企业应该在平时加强税收法规的学习，了解各项税收政策和规定，遵守相关税法，及时纠正存在的问题，提高自我防范意识。

2.认真备案资料：企业应当认真备案相关资料，及时更新资料，确保税务机关能够对企业有一个全面的了解，以便在税务稽查时可以提供完整的资料，减少可能的罚款。

3.与税务机关合作：企业被税务机关稽查时，应积极与税务机关合作，按照要求提供相关资料，解释问题。同时，企业也应注意在合作过程中保护自己的合法权益。

4.及时申诉：如果企业觉得税务机关的处罚不公，可以申请复议或提起诉讼。但是在申诉之前，应先咨询律师的意见，并且准备充分的证据，以便更好地维护自己的权益。

综上所述，企业应该在平时加强税收法规的学习，认真备案资料，积极与税务机关合作，及时申诉，以避免出现税务稽查风险。

税务稽查是税务部门对企业涉税行为进行检查的一种方式，如果企业没有遵守税收法规，就可能面临罚款、税款补缴等后果，导致企业损失。因此，预防和避免税务稽查带来的损失是非常重要的。以下是一些预防和避免税务稽查的方法：

1.严格遵守税收法规：企业要遵守税收法规，按照税务部门要求进行纳税申报和缴纳税款，不要偷逃税款，避免给税务部门留下隐患。

2.合理开具发票：企业要按照规定开具正确的发票，不要开具虚假或过多的发票，以免引起税务部门的注意。

3.规范账务管理：企业应建立完善的会计核算和财务管理制度，规范账务管理，确保账目真实、准确，不要出现造假等违规行为。

4.及时整改问题：如果税务部门进行了稽查并发现了问题，企业要及时整改，避免问题扩大化或再次被发现。

5.积极配合稽查：如果税务部门进行了稽查，企业要积极配合，提供相关资料和信息，并按照税务部门的要求进行整改。

总之，企业要遵守税收法规，建立完善的财务管理制度，合理开具发票，及时整改问题，并积极配合税务部门的稽查工作，才能预防和避免因税务稽查而导致的企业损失。